《黄帝内经》没有辨证论治的概念，辨证论治是当代人对《黄帝内经》思想的发挥和发展，其内涵集症状、舌象、脉象、病因、病机等内容，归纳总结证型。引申辨证论治的外延，可以将中医的所有的临床思维方法统归之于辨证。《黄帝内经》之辨涵盖了天、地、人、时、病、脉、症等各个方面内容。
1.辨阴阳
阴阳既是生命的物质基础，又是中医学的论理方法，阴阳辨证是《内经》辨证理论的基础，在说明人体生理、病理、诊断、治疗各个方面都以阴阳辨证。
《素问•阴阳应象大论篇》云：“察色按脉, 先别阴阳。”
《素问•生气通天论篇》云：“审其阴阳，以别柔刚，阳病治阴，阴病治阳，定其血气，各守其乡。”
《素问•至真要大论篇》说：“谨察阴阳所在而调之，以平为期。”又云：“调气之方, 必别阴阳, 定其中外,各守其乡。”
2.辨表里、寒热、虚实
中医学表里、寒热、虚实的概念和辨证最早见于《黄帝内经》，表里属于病位，寒热、虚实属于病性。
《素问•阴阳应象大论篇》云：“四时阴阳，尽有经纪，外内之应，皆有表里。”
《素问• 阴阳应象大论篇》指出：“ 阴盛则阳病, 阳盛则阴病。阳盛则热, 阴盛则寒。”《素问•调经论》云：“ 阳虚则外寒, 阴虚则内热；阳盛则外热, 阴盛则内寒。”
《素问•调经论篇》云：“百病之生，皆有虚实。”《素问•通评虚实论》说: “邪气盛则实, 精气夺则虚。”《灵枢• 本神》云：“必审五脏之病形, 以知其气之虚实, 谨而调之也。”《素问•方盛衰论》云：“诊合微之事, 追阴阳之变, 章五中之情，其中之论，取虚实之要, 定五度之事，知此乃足以诊。”
3.辨五行
以五行类万物，与人体脏腑生理病理相联属，是中医学辨证特色。
《素问•金匮真言论篇》云：“东方青色，入通于肝，开窍于目，藏精于肝，其病发惊骇……其应四时，上为岁星，是以春气在头也，其音角，其数八，是以知病之在筋也，其臭臊。” 
《灵枢•阴阳系日月》云：“五行以东方为甲乙木王春。春者，苍色，主肝。肝者，足厥阴也。”
4.辨人
《黄帝内经》最早论述了人的体形、体质与疾病辨证。
《灵枢•阴阳二十五人》云：“木形之人, 比于上角, 似于苍帝。其为人苍色, 小头, 长面, 大肩背, 直身, 小手足, 好有才, 劳心, 少力, 多忧劳于事。能春夏不能秋冬, 感而病生。足厥阴佗佗然……火形之人, 比于上徵, 似于赤帝。其为人赤色, 广䏖, 锐面小头, 好肩背髀腹, 小手足, 行安地, 疾心，行摇, 肩背肉满, 有气轻财, 少信，多虑, 见事明, 好颜, 急心, 不寿暴死。能春夏不能秋冬, 秋冬感而病生。 手少阴核核然……土形之人, 比于上宫, 似于上古黄帝。其为人黄色, 圆面, 大头，美肩背, 大腹, 美股胫, 小手足,多肉, 上下相称, 行安地, 举足浮, 安心, 好利人, 不喜权势, 善附人也。能秋冬不能春夏, 春夏感而病生。足太阴敦敦然……金形之人, 比于上商, 似于白帝。其为人方面, 白色, 小头, 小肩背, 小腹, 小手足,如骨发踵外, 骨轻, 身清廉, 急心, 静悍, 善为吏。能秋冬不能春夏, 春夏感而病生。 手太阴敦敦然……水形之人, 比于上羽, 似于黑帝。其为人黑色, 面不平, 大头, 廉颐, 小肩, 大腹, 动手足, 发行摇身, 下尻长, 背延延然, 不敬畏, 善欺绐人, 戮死。能秋冬不能春夏, 春夏感在而生病。足少阴汗汗然。”又云：“二十五人之形血气之所生, 别而以候, 从外知内。”
《灵枢•通天》云：“ 凡五人者, 其态不同, 其筋骨气血各不等。”《灵枢•经水》云: “血之清浊, 气之多少, 十二经之多血少气, 与其少血多气, 与其皆多血气, 与其皆少血气,皆有大数。”
《灵枢•寿夭刚柔》云: “人之生也, 有刚有柔, 有弱有强, 有短有长, 有阴有阳。”《灵枢•五变》云：“柔弱者, 必有刚强, 刚强多怒, 柔者易伤。”《素问•经脉别论》云:“勇者气行则已, 怯者则着而为病也。” 勇怯, 指体质的强弱,若是体质壮实之人, 只会产生一过性的机体失调,故不易为病；而体质虚弱者, 其不平衡状态持续下去而成为疾患。
《素问•五常政大论》指出：“故治病者, 必明天道地理, 阴阳更胜, 气之先后, 人之寿夭, 生化之期, 乃可以知人之形气也。”
5．辨情志
情志包括七情和五志，七情即喜怒忧思悲惊恐，五志为神魂魄意志。
《素问•举痛论篇》云：“怒则气上，喜则气缓，悲则气消，恐则气下，寒则气收，炅则气泄，惊则气乱，劳则气耗，思则气结。”
《素问•阴阳应象大论篇》云：“暴怒伤阴，暴喜伤阳。”
6．辨饮食、气味
《素问•五脏生成篇》云：“是故多食咸，则脉凝泣而变化。”又云：“白当肺、辛，赤当心、苦，青当脾、甘，黑当肾、咸。”
7. 辨脏腑
　脏腑辨证是《黄帝内经》辨证理论体系的核心。
《素问•调经论篇》云：“帝曰: 人有精气津液、四肢、九窍、五藏、十六部、三百六十五节，乃生百病，百病之生，皆有虚实。今夫子乃言有余有五，不足亦有五，何以生之乎? 岐伯曰：皆生于五藏也。”
《素问•咳论篇》云：“五脏六腑皆令人咳，非独肺也。”又云：“脾咳不已，则胃受之，胃咳之状，咳而呕，呕甚则长虫出。”
8．辨经络
经络辨证理论在《黄帝内经》已臻完善。
《灵枢•经脉》云：“肺手太阴之脉，起于中焦，下络大肠，还循胃口，上膈属肺，从肺系横出腋下，下循臑内，行少阴心主之前。下肘中，循臂内上骨下廉，入寸口，上鱼，循鱼际，出大指之端，其支者，从腕后直出次指内廉，出其端。”《灵枢•逆顺肥瘦》云：“ 手之三阴，从脏走手；手之三阳，从手走头。足之三阳，从头走足；足之三阴，从足走腹。”
《灵枢•阴阳系日月》云：“故足之十二经脉，以应十二月，月生于水，故在下者为阴。手之十指，以应十日，日主火，故在上者为阳。黄帝曰：合之于脉，奈何？岐伯曰：寅者，正月之生阳也，主左足之少阳；未者六月，主右足之少阳。卯者二月，主左足之太阳；午者五月，主右足之太阳。辰者三月，主左足之阳明；巳者四月，主右足之阳明，此两阳合于前，故曰阳明。申者，七月之生阴也，主右足之少阴；丑者十二月，主左足之少阴。酉者八月，主右足之太阴；子者十一月，主左足之太阴。戌者九月，主右足之厥阴；亥者十月，主左足之厥阴，此两阴交尽，故曰厥阴。甲主左手之少阳。己主右手之少阳，乙主左手之太阳，戊主右手之太阳。丙主左手之阳明，丁主右手之阳明。此两火并合，故为阳明。庚主右手之少阴，癸主左手之少阴。辛主右手之太阴，壬主左手之太阴。故足之阳者，阴中之少阳也；足之阴者，阴中之太阴也。手之阳者，阳中之太阳也；手之阴者，阳中之少阴也。腰以上者为阳，腰以下者为阴。其于五藏也，心为阳中之太阳，肺为阳中之少阴，肝为阴中之少阳，脾为阴中之至阴，肾为阴中之太阴。” 又云:“五行以东方为甲乙木王春。春者苍色主肝，肝者，足厥阴也。”
9．辨六经
六经之辨最早见于《黄帝内经》，六经发病与天时季节相应，六经与脏腑相通，六经属于十二经，为足六经，张仲景在六经六气理论的基础上发展形成了《伤寒杂病论》辨病脉证理论。
《素问•脉解篇》云：“太阳所谓肿腰脽痛者，正月太阳寅，寅太阳也，正月阳气出在上而阴气盛，阳未得自次也，故肿腰脽痛也……少阳所谓心胁痛者，言少阳盛也，盛者心之所表也，九月阳气尽而阴气盛，故心胁痛也……阳明所谓洒洒振寒者，阳明者午也，五月盛阳之阴也，阳盛而阴气加之，故洒洒振寒也。所谓胫肿而股不收者，是五月盛阳之阴也，阳者衰于五月，而一阴气上，与阳始争，故胫肿而股不收也……太阴所谓病胀者，太阴子也，十一月万物气皆藏于中，故曰病胀……少阴所谓腰痛者，少阴者肾也，十月万物阳气皆伤，故腰痛也……厥阴所谓颓疝，妇人少腹肿者，厥阴者辰也，三月阳中之阴，邪在中，故曰颓疝少腹肿也。”
《素问•热论篇》云：“伤寒一日，巨阳受之，故头项痛腰脊强。二日阳明受之，阳明主肉，其脉侠鼻络于目，故身热目疼而鼻干，不得卧也。三日少阳受之，少阳主胆，其脉循胁络于耳，故胸胁痛而耳聋。三阳经络皆受其病，而未入于脏者，故可汗而已。四日太阴受之，太阴脉布胃中络于嗌，故腹满而嗌干。五日少阴受之，少阴脉贯肾络于肺，系舌本，故口燥舌干而渴。六日厥阴受之，厥阴脉循阴器而络于肝，故烦满而囊缩。三阴三阳，五脏六腑皆受病，荣卫不行，五脏不通，则死矣。”
10．辨营卫气血
气血辨证是《黄帝内经》辨证理论的重要内涵，卫气营血理论最早源于《黄帝内经》。
《素问•调经论篇》云：“人之所有者，血与气耳。”又云： “血气不和，百病乃变化而生。”
《素问•至真要大论篇》云：“气有多少，病有盛衰，治有缓急，方有大小，愿闻其约奈何? 岐伯曰：气有高下，病有远近，证有中外，治有轻重，适其至所为故也。”
《灵枢•营卫生会》云： “黄帝曰：老人之不夜瞑者，何气使然？少壮之人不昼瞑者，何气使然？岐伯答曰：壮者之气血盛，其肌肉滑，气道通，荣卫之行，不失其常，故昼精而夜瞑。老者之气血衰，其肌肉枯，气道涩，五藏之气相搏，其营气衰少而卫气内伐，故昼不精，夜不瞑。”
《灵枢•五乱》云：“何谓逆而乱？岐伯曰：清气在阴，浊气在阳，营气顺脉，卫气逆行，清浊相干，乱于胸中，是谓大悗。故气乱于心，则烦心密嘿，俯首静伏；乱于肺，则俯仰喘喝，接手以呼；乱于肠胃，则为霍乱；乱于臂胫，则为四厥；乱于头，则为厥逆，头重眩仆。”
   11．辨色
辨色是《黄帝内经》望诊理论的重要内容，五色辨证是《黄帝内经》的重要内容。
　《素问•脉要精微论篇》云：“五色者，气之华也，赤欲如白裹朱，不欲如赭；白欲如鹅羽，不欲如盐；青欲如苍璧之泽，不欲如蓝；黄欲如罗裹雄黄，不欲如黄土；黑欲如重漆色，不欲如地苍。”
《素问•五脏生成篇》云：“白当肺、辛，赤当心、苦，青当肝、酸，黄当脾、甘，黑当肾、咸。”“故色见青如草兹者死，黄如枳实者死，黑如焰者死，赤如衃血者死，白如枯骨者死……青如翠羽者生，赤如鸡冠者生，黄如蟹腹者生，白如豕膏者生，黑如乌羽者生。”
《灵枢•五色》云：“青黑为痛，黄赤为热，白为寒……其色粗以明，沉夭者为甚，其色上行者病益甚，其色下行如云彻散者病方已。五色各有脏部，有外部，有内部也。色从外部走内部者，其病从外走内；其色从内走外者，其病从内走外……五色各见其部，察其浮沉，以知浅深，察其泽夭，以观成败，察其散抟，以知远近，视色上下，以知病处。”  
《灵枢•论疾诊尺》云：“目赤色者病在心，白在肺，青在肝，黄在脾，黑在肾。”   
12．辨六淫
　六淫是中医病因学的基本概念，源起于《黄帝内经》。
《素问•生气通天沦篇》：“因于寒, 欲如运枢, 起居如惊,神气乃浮。因于暑, 汗, 烦则喘喝, 静则多言, 体若燔炭, 汗出而散。 ”
《素问•阴阳应象大论篇》云：“风胜则动, 热胜则肿, 燥胜则干，寒胜则浮, 湿胜则濡泻。”
13.辨脉
辨脉是中医理论的特色内涵，切脉是四诊主要内容之一，《黄帝内经》形成了系统的中医脉学理论。
《素问•玉版论要篇》云：“道之至数，五色脉变，揆度奇恒，道在于一。”
《素问•脉要精微论篇》云：“夫脉者，血之府也，长则气治，短则气病。”
《灵枢•逆顺》云：“ 脉之盛衰，所以候血气之虚实有余不足。” 
《素问•脉要精微论篇》云：“微妙在脉，不可不察， 察之有纪，从阴阳始。始之有经，从五行生，生之有度，四时为宜，补泻勿失，与天地如一，得一之情，以知死生。”
《素问•平人气象论篇》云：“脉弱以滑, 是有胃气。”
《灵枢•终始》云：“谷气来也，徐而和。”
《素问•三部九候论篇》云：“何以知病之所在? 岐伯曰：察九候独小者病, 独大者病, 独疾者病,独迟者病, 独热者病, 独寒者病, 独陷下者病。”
《素问•平人气象论篇》云：“寸口之脉中手短者, 曰头痛。寸口之脉中手长者，曰足胫痛。 寸口脉中手促上击者, 曰肩背痛。寸口脉沉而坚者，曰病在中。寸口脉浮而盛者，曰病在外。寸口脉沉而弱，曰寒热及疝瘕少腹痛。寸口脉沉而横，曰胁下有积，腹中有横积痛。寸口脉沉而喘，曰寒热。”
14．辨病
《黄帝内经》对病的认识很多，虽然没有给予明确的疾病概念，但辨病是中医诊断、治疗的前提，《黄帝内经》提出了各种病名、诊断和治疗方法。
《素问•刺热论篇》云：“肝热病者，小便先黄，腹痈多卧，身热。”
《灵枢•痈疽》云：“发于腋下赤坚者，名曰米疽。治之以砭石，欲细而长，疏砭之，涂以豕膏，六日已，勿裹之……发于膝，名曰疵痈。其状大痈，色不变，寒热，如坚石，勿石，石之者死。须其柔，乃石之者生。”
15．辨症状
中医学的辨证论治，在《黄帝内经》是辨症论治。
　《素问•脉要精微论篇》云：“头者精明之府，头倾视深，精神将夺矣。背者胸中之府，背曲肩随，府将坏矣。腰者肾之府，转摇不能，肾将惫矣。膝者筋之府，屈伸不能，行则偻附，筋将惫矣。骨者髓之府，不能久立，行则振掉，骨将惫矣。”
《素问•咳论篇》云：“肺咳之状，咳而喘息有音，甚则唾血。”
《灵枢•海论》云:“气海有余者, 气满胸中, 悗息面赤……水谷之海有余, 则腹满。”
16．辨病位
《黄帝内经》非常注意辨病位，阴阳、表里、内外、脏腑、经络、气血等都属于病位。
《素问•平人气象论篇》云：“脉小实而坚者，病在内。”
《素问•玉机真脏论篇》云：“病入舍于肺，名肺痹，发咳上气。”
《素问•藏气法时论篇》：“肝病者，两胁下痈引少腹，令人善怒。”
17．辨病邪传变
　病邪传变理论发源于《黄帝内经》。
《素问•玉机真脏论篇》云：“五脏相通，移皆有次，五脏有病，各传其所胜。”
《素问•热论篇》云：“伤寒一日，巨阳受之，故头项强腰脊痛……二日，阳明受之……三日，少阳受之……四日，太阴受之……五日，少阴受之……六日，厥阴受之。”
《灵枢•病传》云: “病先发于心, 一日而之肺, 三日而之肝, 五日而之脾，三日不已。死, 冬夜半, 夏日中。” 
18．辨病势
《黄帝内经》大量论述了疾病发展趋势。
《素问•脉要精微论篇》云：“风成为寒热……久风为飱泄……脉风成为疠，病之变化，不可胜数。”
《素问•平人气象论篇》云：“脉从阴阳，病易已；脉逆阴阳，病难已。”
19．辨天地运气
天人相应是中医学的基本方法，是中医理论之魂，五运六气理论是对天人相应理论的具体表达，天地运气辨证是中医学的基本方法。
《素问•六节藏象论篇》云：“不知年之所加，气之盛衰，虚实之所起，不可以为工矣。”
《灵枢•刺节真邪》云：“与天地相应, 与四时相副，人参天地，故可为解。”
《素问•宝命全形论篇》云: “法天则地, 随应而动, 和之者若响, 随之者若影。”
《素问•解精微论篇》云：“人气不足, 天气如虚。”
《灵枢•岁露论》说：“人与天地相参也，与日月相应也。故月满则海水西盛，人血气积，肌肉充，皮肤致，毛发坚，腠理郄，烟垢著。当是之时，虽遇贼风，其入浅不深。至其月郭空，则海水东盛，人气血虚，其卫气去，形独居，肌肉减，皮肤纵，腠理开，毛发残，膲理薄，烟垢落。当是之时，遇贼风则其入深，其病人也卒暴。”
《素问•八正神明论篇》云：“天温日明，则人血淖液而卫气浮，故血易泻，气易行；天寒日阴，则人血凝泣而卫气沉。月始生，则血气始精，卫气始行；月郭满，则血气实，肌肉坚；月郭空，则肌肉减，经络虚，卫气去，形独居。”
《素问•五癃津液别篇》云：“天暑衣厚则腠理开, 故汗出。天寒则腠理闭, 气涩不行, 水下留于膀胱, 则为溺与气。”
《素问•生气通天论篇》说: “故阳气者, 一日而主外, 平旦人气生, 日中而阳气隆, 日西而阳气已虚, 气门乃闭。”
20. 辨地域、空间
因地辨证、因地制宜是中医学的科学辨证方法，最早见于《黄帝内经》。
《素问•异法方宜论篇》云：“故东方之域，天地之所始生也，鱼盐之地，海滨傍水，其民食鱼而嗜咸，皆安其处，美其食，鱼者使人热中，盐者胜血，故其民皆黑色疏理，其病皆为痈疡，其治宜砭石，故砭石者，亦从东方来。”
《素问•六微旨大论篇》云：“高下相召，升降相因。”
21．辨时间
　时间医学辨证理论在《黄帝内经》提出并广泛应用。
《素问•疏五过论篇》云：“圣人之治病也, 必知天地阴阳, 四时经纪。”
《灵枢•五变》云：“先立其年，以知其时。时高则起，时下则殆，虽不陷下，当年有冲通，其病必起，是谓因形而生病，五变之纪也。”
《灵枢•四时气》指出：“四时之气, 各有所长。”
《素问•厥论篇》说：“春夏则阳气多而阴气少, 秋冬则阴气盛而阳气衰。”
 《灵枢•阴阳系日月》云: “正月、二月, 人气在左……四月五月六月, 人气在右……七月八月九月, 人气在右……十月十一月十二月, 人气在左。”  
《素问•藏气法时论篇》云：“至其所生而愈, 至其所不胜而甚, 至其所生而持, 自得其位而起。”又云：“病在肝，愈于夏，夏不愈，甚于秋，秋不死，持于冬，起于春，禁当风。”
《灵枢•顺气一日分为四时》说：“朝则人气始生，病气衰，故旦慧；日中人气长，长则胜邪，故安； 夕则人气始衰，邪气始生，故加；夜半人气入脏，邪气独居于身，故甚也。” 
22．辨梦
梦的辨证在《黄帝内经》中有许多论述，其科学原理需要进一步探讨。
《素问•诊要经终论篇》云：“秋刺夏分，病不已,令人益嗜卧,又且善梦……冬刺春分,病不己,令人欲卧不能眠, 眠而有见。”
《素问•脉要精微论篇》说：“是知阴盛则梦涉大水恐惧, 阳盛则梦大火燔灼，阴阳俱盛则梦相杀毁伤；上盛则梦飞，下盛则梦堕；甚饱则梦予，甚饥则梦取；肝气盛则梦怒，肺气盛则梦哭；短虫多则梦聚众，长虫多则梦相击毁伤。”
《素问•方盛衰论篇》云：“是以少气之厥，令人妄梦，其极至迷。三阳绝，三阴微，是为少气。是以肺气虚则使人梦见白物，见人斩血借借，得其时则梦见兵战。肾气虚则使人梦见舟船溺人，得其时则梦伏水中，若有畏恐。肝气虚，则梦见菌香生草，得其时则梦伏树下不敢起。心气虚则梦救火阳物，得其时则梦燔灼。脾气虚则梦饮食不足，得其时则梦筑垣盖屋。”
《灵枢•淫邪发梦》云：“正邪从外袭内，而未有定舍，反淫于脏，不得定处，与营卫俱行，而与魂魄飞扬，使人卧不得安而喜梦。气淫于腑，则有佘于外，不足于内；气淫于脏，则有余于内，不足于外。” 又云：“厥气客于心, 则梦见丘山烟火；客于肺，则梦飞扬，见金铁之奇物；客于肝，则梦山林树木；客于脾，则梦见丘陵大泽，坏屋风雨；客于肾，则梦临渊，没居水中；客于膀肤，则梦游行；客于胃，则梦饮食；客于大肠，则梦田野；客于小肠，则梦聚邑冲衢；客于胆，则梦斗讼自刳；客于阴器，则梦接内；客于项，则梦斩首；客于胫，则梦行走而不能前，及居深地窖苑中；客于股肱，则梦礼节拜起；客于胞腹，则梦溲便。”
23．系统全面辨证
《黄帝内经》的辨证理论体系非常完善，各种辨证方法的目的是为了治疗疾病，《黄帝内经》提倡系统全面的辨证思维。
《素问•方盛衰论篇》说：“诊有大方，坐起有常，出入有行，以转神明，必清必静。上观下观，司八正邪，别五中部，按脉动静，循尺滑涩寒温之意，视其大小，合之病能，逆从以得，复知病名，诊可十全，不失人情。”指出医生一边按一定的常规和步骤仔细诊察病情，一边认真思考，只有通过对病因、病机(病位、病性、病势)等全面分析, 最后才能综合得出正确的诊断。
《素问•疏五过论篇》云：“圣人之治病也，必知天地阴阳，四时经纪，五藏六腑，雌雄表里，刺灸砭石、毒药所主，从容人事，以明经道，贵贱贫富，各异品理，问年少长，勇怯之理，审于分部，知病本始，八正九候，诊必副矣。”